Magdalena Lisak ukończyła z wyróżnieniem Akademię Muzyczną im. Karola Szymanowskiego w Katowicach, w klasie prof. Andrzeja Jasińskiego (1994). Studiowała także w Konserwatorium w Zurychu u Homero Francescha (1994-1996) oraz w Musik-Akademie w Bazylei pod kierunkiem Krystiana Zimermana (1996-1998).
Jest laureatką VI nagrody na XIII Międzynarodowym Konkursie Pianistycznym im. Fryderyka Chopina w Warszawie w 1995 roku. Jej interpretacje zostały utrwalone na płytach CD dla Polskiego Radia, CD Accord oraz serii Narodowego Instytutu im. Fryderyka Chopina The Real Chopin. Występuje z recitalami, wykonuje koncerty z orkiestrami i zespołami kameralnymi w Polsce i większości krajów europejskich, a także USA, Kanadzie, Japonii, Chinach i Brazylii. W 2000 roku wykonała dla György Ligetiego jego Etiudy, których interpretacja spotkała się z wysoką oceną kompozytora. Dokonała prawykonań w ramach festiwali: Śląskie Dni Muzyki Współczesnej w Katowicach, Międzynarodowy Festiwal Dni Muzyki Kompozytorów Krakowskich, Międzynarodowy Festiwal Muzyki Współczesnej Laboratorium w Warszawie i Białymstoku oraz Festiwalu Warszawska Jesień. Występowała w charakterze solistki z takimi dyrygentami jak: Kazimierz Kord, Tadeusz Strugała, Tomasz Bugaj, Mirosław Jacek Błaszczyk, Jerzy Salwarowski, Massimiliano Caldi, Agnieszka Duczmal, Jacques Mercier, Reinbert de Leeuw, Jacek Kaspszyk, Ewa Strusińska. Na zaproszenie Narodowego Instytutu im. Fryderyka Chopina podjęła się wykonań, a także rejestracji utworów Chopina na instrumentach historycznych. Realizuje projekty artystyczne pod egidą Śląskiego Towarzystwa Muzycznego, którego jest założycielką i prezesem.
Uczestniczyła w jury International Chopin Piano Competition in Asia (2010-2023), Komisji Kwalifikacyjnej XV Międzynarodowego Konkursu Pianistycznego im. Fryderyka Chopina w Warszawie (2010) i Międzynarodowego Konkursu Muzycznego im. Karola Szymanowskiego w Katowicach (2023), a także 54. Beethovenův Hradec International Music Competition (2016, 2022) w Hradec nad Moravici (Czechy).
Magdalena Lisak prowadzi klasę fortepianu katowickiej Akademii Muzycznej, od 2019 roku będąc Kierownikiem Katedry Fortepianu. Jej działalność pedagogiczna obejmuje m.in. kursy mistrzowskie na Międzynarodowym Kursie Pianistycznym w Katowicach, Chopin International Masterclass w Tokio, kursy na Uniwersytecie w Ostrawie, Narodowej Akademii Muzycznej w Sofii oraz wykłady na polskich i japońskich wyższych uczelniach artystycznych.
